体構造は、中心部にある薄いオレンジ色の内臓部と、それを取り囲むように存在する白色の運動器官に大別される。外縁部に位置するひれ状の構造（目玉焼きで言うところの、粘度の低い卵白が焼成されてできた白身に相当する）を用いて水中を遊泳する。
他生物との類縁関係については、遺伝子解析の結果を待たねばならない。ニワトリとの類縁関係が立証されれば、『卵が先か、鶏が先か』という古代からの問いに対し、『目玉焼き』という第三の選択肢が加わることとなるだろう。
